Acetatul de metil dăunează organismului uman: are efecte anestezice și stimulatoare. Persoanele expuse la concentrații mai mari ale acestui produs pot provoca simptome de iritare a ochilor, nasului, gâtului și tractului respirator. Contact repetat sau prelungit cu anestezie progresivă. După oprirea contactului, recuperarea este mai lentă, provocând uneori opacitate corneană. Aceasta poate provoca dermatită și eczeme pe piele. Expunerea la vapori de acest produs poate provoca iritarea ochilor, udare, dispnee progresivă, dureri de cap, amețeli, palpitații, depresie, și depresia sistemului nervos central.
Metanolul produs prin descompunerea sa poate provoca pierderea vederii, reducerea câmpului vizual și atrofia nervului optic. Concentrația ridicată poate provoca anestezie și congestie hepatică și renală; inhalarea continuă la scară largă poate provoca edem pulmonar acut. Efectele cronice pot include anemie secundară, leucocitoză, turbiditate viscerală, și steatoza. Ocazional, persoanele care sunt alergice la acest produs poate provoca sângerări gingivale din cauza tulburărilor nervoase vasculare după o cantitate mică de inhalare.